LNP（脂質納米顆粒）相較于凍干技術在復雜程度上更高。LNP是由特定類型的脂質按照一定比例制成的納米結構顆粒，通過明確的工藝組裝而成。在LNP的制備過程中，物理化學參數如顆粒大小、分散性以及適當的有效藥物封裝率非常重要，因為它們直接影響到LNP的生物學性能。這些參數必須在凍干過程和后續存儲中得以保留。
為了確保LNP的保存，選擇合適的凍干緩沖液、循環過程參數和溫度非常關鍵。這些因素能夠幫助維持LNP的穩定性和活性，從而確保其在儲存期間不發生變化。因此，在制備和保存LNP時，需要仔細考慮這些因素的選擇和控制，以確保其質量和效果的穩定性。
相關研究表明，含有小干擾(si) RNA或mRNA的LNPs可以成功地被凍干，但也有研究者發現，siRNA-LNPs可以被凍干，但在用水復溶后，其功效(細胞培養中基因沉默效果)突出降低。
近的兩項研究表明，mRNA-LNP平臺可以被凍干。Zhao等人研究了編碼螢火蟲熒光素的凍干mRNA-LNP，并通過小鼠體內生物發光成像研究確認了復溶后的產物維持了mRNA的表達效率。Hong等人開發了一種凍干 SARS-CoV-2 mRNA-LNP 疫苗配方，并表明該疫苗可以在小鼠體內誘導強烈的免疫應答。
